25 listopadu, 2019
SeqMonk
(4 / 5)
Vydavatel: | Babraham Bioinformatics |
Verze: | 1.45.4 |
Velikost: | 45.25MB |
Licence: | Omezená: Trial |
Vizualizace a analýza mapovaných dat
SeqMonk je nástroj pro vizualizaci a studii mapovaných dat. Je přizpůsoben pro používání s mapovanými sekvenčními daty, nicméně lze jej použít pro libovolnou datovou množinu vyjádřenou řadou genomických pozic.
Program umožňuje importovat mapovaná data z BAM, SAM, Bowtie a dalších, tvořit datové skupiny pro vizualizaci a analýzu, vizualizovat mapované regiony oproti anotovanému genomu, kvantifikovat mapovaná data pro porovnání datových sad, dělat statistickou studii dat pro vyhledání regionů či tvořit reporty.